{"id":23102754,"url":"https://github.com/dataxujing/install-r-rstudio-server-shiny-server-git","last_synced_at":"2026-01-18T06:52:42.993Z","repository":{"id":112305356,"uuid":"92385557","full_name":"DataXujing/Install-R-rstudio-server-shiny-server-git","owner":"DataXujing","description":"ubuntu 16.04 install some solft about open source R by XuJing","archived":false,"fork":false,"pushed_at":"2017-05-26T10:07:25.000Z","size":2744,"stargazers_count":1,"open_issues_count":0,"forks_count":2,"subscribers_count":1,"default_branch":"master","last_synced_at":"2025-02-09T09:29:05.179Z","etag":null,"topics":[],"latest_commit_sha":null,"homepage":"","language":null,"has_issues":true,"has_wiki":null,"has_pages":null,"mirror_url":null,"source_name":null,"license":null,"status":null,"scm":"git","pull_requests_enabled":true,"icon_url":"https://github.com/DataXujing.png","metadata":{"files":{"readme":"README.md","changelog":null,"contributing":null,"funding":null,"license":null,"code_of_conduct":null,"threat_model":null,"audit":null,"citation":null,"codeowners":null,"security":null,"support":null,"governance":null,"roadmap":null,"authors":null,"dei":null,"publiccode":null,"codemeta":null}},"created_at":"2017-05-25T09:07:21.000Z","updated_at":"2022-01-21T13:29:15.000Z","dependencies_parsed_at":"2023-05-12T15:00:30.469Z","dependency_job_id":null,"html_url":"https://github.com/DataXujing/Install-R-rstudio-server-shiny-server-git","commit_stats":null,"previous_names":[],"tags_count":0,"template":false,"template_full_name":null,"repository_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/DataXujing%2FInstall-R-rstudio-server-shiny-server-git","tags_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/DataXujing%2FInstall-R-rstudio-server-shiny-server-git/tags","releases_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/DataXujing%2FInstall-R-rstudio-server-shiny-server-git/releases","manifests_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/DataXujing%2FInstall-R-rstudio-server-shiny-server-git/manifests","owner_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/owners/DataXujing","download_url":"https://codeload.github.com/DataXujing/Install-R-rstudio-server-shiny-server-git/tar.gz/refs/heads/master","host":{"name":"GitHub","url":"https://github.com","kind":"github","repositories_count":247081209,"owners_count":20880390,"icon_url":"https://github.com/github.png","version":null,"created_at":"2022-05-30T11:31:42.601Z","updated_at":"2022-07-04T15:15:14.044Z","host_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub","repositories_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories","repository_names_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repository_names","owners_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/owners"}},"keywords":[],"created_at":"2024-12-17T00:00:26.360Z","updated_at":"2026-01-18T06:52:42.941Z","avatar_url":"https://github.com/DataXujing.png","language":null,"funding_links":[],"categories":[],"sub_categories":[],"readme":"# Install-R-rstudio-server-shiny-server-git\n\nby Xujing\n\n\n\n## 1. 你应该装一个Ubuntu系统\n\n首先安装一个虚拟机，然后安装Ubuntu，作者使用的为Ubuntu 16.04,所有安装配置\n都是在该版本下进行的，建议虚拟机安装，这样可以在Windows系统和Ubuntu下随意切换\n且无障碍copy文件，不推荐U盘安装Ubuntu双系统，这样在系统切换中需要重启电脑比较麻烦。\n相关安装教程可参考：[VMareUbuntu安装详细过程](http://blog.csdn.net/u013142781/article/details/50529030)\n\n\n\n## 2. Linux安装最新版本的R\n\n安装步骤非常简单，且基本不会出现问题\n\n+ step1: 打开终端，在终端内输入：sudo apt-get install r-base\n\n+ step2: 更新软件源列表并更新R软件 sudo apt-get update; sudo apt-get install r-base r-base-dev;\n此时输入R 可以打开看是否为最新版本\n\n+ step3: 提示：如果已经安装了旧版本的R-base，或许用 sudo apt-get upgrade 也可以更新到最新版本\n\n+ step4： 在终端中输入 R，如果能正常打开，恭喜你，你已经成功安装了最新版本的R,这里需要注意的是如果只运行\nstep1你可能仅仅安装了一两年前的版本，并非最新的R版本。\n\n+ step5： 安装pacakges只需打开R输入：`install.packages(\"packagesnames\")` 或`devtools::install-github(\"path/packagesnames\")`\n稍等片刻会提示选择镜像，然后就可以安装了，在安装过程中作者踩了很多坑，大体分为三类：ubuntu分配内存不足或缺少必备的一些依赖包\n或者镜像资源不稳定。具体解决办法可在问题区域得到回答。\n\n当然除了这种在线安装之外，你也可以选择离线安装.zip文件，安装步骤分为三步，下载，解压，安装相关教程可google或Baidu解决: [点我](http://blog.sina.com.cn/s/blog_6583048d01018ac5.html)中的方法2即可离线安装。\n\n## 3. 安装 rstudio-server\n\nrstudio server可以让你的rstudio运行在网页上，并且很好的与git结合进行数据科学项目的协同开发。它分为普通版和满血版(rstudio server pro，收费的),\n作为数据科学的发烧友可以玩一玩普通版，有条件还是要购买服务（为Rstudio打广告）其安装步骤也很简单。\n\n+ step1:  sudo apt-get install gdebi-core\n+ step2:  sudo apt-get install libapparmor1  # Required only for Ubuntu, not Debian\n+ step3: wget http://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.97.551-amd64.deb\n+ step4: sudo gdebi rstudio-server-0.97.551-amd64.deb\n+ step5: 查看rstudio-server: ps -aux|grep rstudio-server， 恭喜你rstudio-server的服务已启动, 8787端口被打开。\n+ step6： ifconfig 查看ip地址，在浏览器中输入\u003chttp://ip:8787\u003e或\u003chttp://localhost:8787\u003e,跳出界面，输入你Ubuntu的登录账号和密码即可登录进你的\nrstudio-server,例如我的用户名xujing\n\n![rstudio-server登录](load.png)\n\n+ step7：注意在登录时不要使用root权限用户，这样会出错。\n\n+ step8: 太帅了，是不是web版的rstudio！！！\n\n![登录成功的界面](success.png)\n\n踩过的坑：我曾在32位ubuntu14.04版本下安装过最新版本的rstudio-server，发现安装成功后无法启动rstudio server，各种大牛咨询，最后卸掉重新安装了低版本的，问题解决了，这个故事告诉我们\n在安装过程中如果无法安装，可尝试几种不同的版本，总有一个适合你。\n\n安装好你的开源工具，就可以站在巨人的肩膀上安装各种packages，过程中你会在内心呐喊总有一天我也会写出一些牛B的packages，为开源社区尽微薄之力， 有了rstudio server和git我们就可以开发自己的packages\n及时上传到世界最大的同性交友社区Github，读者可以在作者（DataXujing)中看到我开发测试的几个程序包，入门足以。让我们在享受开源的同时，也为开源社区添砖加瓦。\n\n\n使用浏览器运行R的好处：\n\n+ **你可以从任何一台能上网的计算机去操作R**\n+ **共享代码、数据和其它文档**\n+ **多用户共享高性能计算资源与协同工作** \n+ **集中管理R扩展包** \n\n## 4. Git\n\n\nGit属于分散型版本管理系统，是为版本管理而设计的软件。Linux的创始人\nLinus Torvalds在2005年开发了Git的原型程序。当时，由于在Linux内核开发中\n使用的既有版本管理系统的开发方许可证发生了变更，为了更换新的版本管理系统，Torvalds开发了Git。\n\nLinux内核的更新速度在全世界也算是首屈一指。因此势必需要一个功能强,性能高的版本管理系统来提高开发速度。\nGit是由Linus Torvalds亲自着手开发的，可以说在功能上与性能方面无可挑剔。\n程序员们愿意接受Git,很大程度上取决于这个背景。\nGit功能多到夸张，让人觉得至今都没有彻底掌握她，现在如果没有Git软件，开发恐怕成为一件非常痛苦的事情。在发布之初，Git由于其艰涩难懂，只有部分黑客使用，但随着众多开发者的努力，现在他被全世界的码农们所采用。\n\n### (1). 让我们围观Git的安装与推送远程仓库(GitHub)：\n\n+ #安装git, sudo apt-get install git\n\n+ #生成rsa密钥对  ssh-keygen -t rsa\n\n+ #查看公钥并  cat /home/xujing/.ssh/id_rsa.pub\n\n+ 把公钥并上传到github\n\n+ 在GitHub上创建一个新的Project: RstudioTest\n\n+ 绑定本地项目(/home/xujing/R/下建文件夹github,放入创建的项目）\n\n+ cd /home/xujing/R/github\n  \n  - git init  #在当前项目工程下履行这个号令相当于把当前项目git化\n\n  - git add . #把当前目次下代码参加git的跟踪中，意思就是交给git经管，提交到本地库\n\n  - git commit -m 'RstudioTest1' #相当于写点提交信息，如果这步有错误，可以按照提示输入userid xu*** email *****\n\n  - git remote add origin git@github.com:bsspirit/rstudio-demo.git #这个相当于指定本地库与github上的哪个项目相连\n\n  - git push -u origin master #将本地库提交到github上\n\n+ 恭喜你,完成了。\n\n\n### (2). 踩过的坑\n\n\n+ git init 产生的目录解释：`error: src refspec master does not match any.`\n  - 解释：引起该错误的原因是，目录中没有文件，空目录是不能提交上去的\n\n+ `error: insufficient permission for adding an object to repository database ./objects`\n\n  - 服务端没有可写目录的权限\n  - 错误提示：fatal: remote origin already exists.\n  - 解决办法：$ git remote rm origin\n  - 错误提示：error: failed to push som refs to ........\n  - 解决办法：$ git pull origin master //先pull 下来 再push 上去\n\n\n\n### (3). 其他简单命令\n\n+ git clone git＠github.com:DataXujing/....git #将github上的项目down下来。\n\n+ git fetch origin  #取得长途更新，这里可以看做是筹办要取了\n\n+ git merge origin/master   #把更新的内容归并到本地分支/master\n\n+ 下面是删除文件后的提交\n\n  - git status  #可以看到我们删除的哪些文件\n\n  - git add .  #删除之后的文件提交git经管。\n\n  - git rm a.c  #删除文件\n\n  - git rm -r gittest  #删除目次\n\n+ git reset --hard HEAD 回滚到add之前的状态\n+ git diff 比较的是跟踪列表中的文件和文件系统中文件的差别\n\n\n## 5. Shiny-server共享我的ShinyApp\n\n### (1). 运行shiny的方式\n\n\n假设现在你可以创建一个有用的Shiny应用了，但怎样与小伙伴们一同分享自己\n的应用呢？首先将向你展示与他人分享Shiny\n应用的几种方法。两个基本的分享选择是：\n  \n+ 以两个文件server.R和ui.R的形式来分享你的Shiny应用\n  - 这是最简单的分享方式，但是仅当你的用户在电脑上安装了R，并且知晓如何使用R后，这才得以实现。用户可以在自己的电脑上运行这些脚本来打开程序，就像你平常运行应用程序一样。\n  \n+ 以网页形式分享你的Shiny应用。这无疑是分享应用最友善的途径。用户可\n以通过互联网打开浏览器对应用进行操作。他们会发现你的应用完全渲染呈\n现、即刻更新，并且操作自如。\n  \n+ 两个R文件的共享形式拥有R语言的任何人都可以运行你的应用。他们仅需要你的server.R和ui.R的一份副本（copy）即可， 同时在一些情况下也需要一些应用中的补充材料（如www文件夹或者是helpers.R文件）。\n可以通过发送email(以zip文件的形式)或者在线共享来传播你的文件。你的用户可以将文件存放在一个他们自己的目录中。\n仅需在命令行中输入以下命令即可运行，与你在电脑上的操作别无二致。\n  - `#install.packages(\"shiny\")`\n  - `library(shiny)`  \n  - `runApp(\"shiny-REmap\")`  \n\n+ Shiny拥有三个内置命令可以使打开在线文件变得轻松快捷，它们是：runUrl, runGitHub和runGist. \n\n+ **runUrl**: runUrl会直接从网络链接中下载运行一个Shiny应用。使用runUrl的方法是：将你的\n   Shiny应用目录保存为zip文件。在网页中上传zip文件获得超链接，任何人都可以访问链接并且加以运行， 只需在R命令行中输入：\n\n   - library(shiny)  \n   - runUrl(\"\u003cthe web link\u003e\") \n\n+ **runGitHub**:  如果你没有属于自己的网页来托管文件，你可以在 \u003chttp:github.com\u003e 上免费托管自己的文件。\n  使用GitHub，你需要注册（sign up）并且选取一个用户名（user name）。\n 通过GitHub来分享自己的应用，请在GitHub上创建一个项目存储库（project repository），然后在存储库中保存你的server.R和ui.R文件，以及一些运行程序所需的补充文件。你的用户可以通过以下代码运行你的Shiny应用。\n  `runGitHub(\"shiny-REmap\",\"DataXujing\")` \n以网页形式分享应用\n  \n+ 以上的分享方式有着同样的限制条件，他们需要你的用户事先在电脑上安装好R与Shiny包。\n  然而，Shiny提供了绝好的分享方式，使得用户安装R语言不是必须的硬性要求。你的Shiny应用会用世界上最流行的传播\n  工具：网页，来进行分享。如果你有自己应用的URL，用户可以访问这个应用程序（并且丝毫不必担心代码的问题）。\n  如果你对网页保存应用驾轻就熟，或者你有权限接触某个IT部门，你可以自己主宰自己的Shiny应用。\n  如果你期待一个更为简便的方式或者需要专家支持，RStudio提供三种方法来将你的Shiny应用放入网页中，这三种方法是：\n  \n  1. Shinyapps.io \n\n  2. Shiny Server\n  \n  3. Shiny Server Pro \n\n\n\n### (2). 安装Shiny server\n\n+ step1: sudo apt-get install gdebi-core\n+ step2: wget https://download3.rstudio.org/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-1.5.3.838-amd64.deb\n+ step3: sudo gdebi shiny-server-1.5.3.838-amd64.deb\n+ step4: 默认端口号3838，打开浏览器输入\u003chttp://localhost:3838\u003e或 \u003chttp://ip:3838\u003e ,如图所示，恭喜你成功了：\n![3838登陆成功](shinyserver.png)\n\n踩过的坑：\n\n1. 如果不想中断shiny应用来更新应用可以用下面的命令：sudo reload shiny-server\n\n2. shiny server的lib与R的lib不是同一个，在R中输入`\u003e .libPaths()`，查看路径。如果你想在shiny server中安装packages,可在终端中输入：\n`$ sudo su - -c \"R -e \\\"install.packages('packages')\\\"\"`或`$ sudo su - -c \"R -e \\\"devtools::install_github('packages')\\\"\"`，当然你还可以\n修改镜像，使得你在被墙掉的前提下链接国内一些镜像资源\n\n3. 切记一定要在shiny server 对应的lib中安装shiny和rmarkdown,否则不会正常启动shiny server\n\n\n+ 应用程序位置\nShiny Server默认会在/srv/shiny-server/sample-apps中存放shiny代码文档，你可以在浏览器中输入该路径运行你的shinyApp。\n![运行成功](successshiny.png)\n\n![例子](shinyexample1.png)\n\n\n\n\n\n## 6. Win64下安装 R server \n\n\n\n**声明：[该部分转载自雪晴数据网](http://www.xueqing.tv/cms/article)**\n\n![pic1](serverpic/rserver1.png)\n\nMicrosoft R Server 以前称为 Revolution R Enterprise (RRE)，原来为Revolution Analytics公司的产品。 微软在2015年一月份宣布收购Revolution Analytics，\n现在SQL Server 2016已经支持连接R语言和Microsoft R Server的大数据算法。\n\nMicrosoft R Server支持各种大数据分析、预测模型和机器学习功能，并为用户提供与 R 语言完全兼容的最经济高效且速度最快的大数据分析，这实际上就是现代分析用户的标准。 \n虽然很多人对这个商业版的R感兴趣，但国内网站上一直没有关于Microsoft R Server的资料，也不知道从哪里下载软件。\n2015年11月，微软发布了全新的Visual Studio Dev Essentials项目，致力于为开发者提供为任意平台创建、编译和部署应用所需的所有开发工具。该项目包括免费应用（涵盖Visual Studio Community 和Visual Studio Express）、访问云服务和软件测试。本文将介绍通过Visual Studio Dev Essentials网站免费下载最新版的Microsoft R Server，以及安装中需要注意到问题。 \n\n### 加入Visual Studio Dev Essentials \n\n进入网站 \u003chttps://www.visualstudio.com/dev-essentials\u003e，点击立即加入或访问（如果你看到的是英文界面，就是点击Join or Access Now），如\n果有 Microsoft 账户直接登录，没有则注册Microsoft 账户。 \n\n![pic2](serverpic/rserver2.jpg)\n\n登录之后，不管跳转到哪里，请确保最后你都进入页面\u003chttps://my.visualstudio.com\u003e\n\n如果你之前没有加入 Visual Studio Dev Essentials，那么你会在页面上看到下面的一行提示 To access the following Visual Studio Dev Essentials benefits, please accept the terms of the program. 点accept \n\n![pic3](serverpic/rserver3.png)\n\n同意了用户协议之后，你再看Subscriptions这页，已经有Visual Studio Dev Essentials的免费订阅了。 \n\n![pic4](serverpic/rserver4.png)\n\n\n### 第二步：下载Microsoft R Server \n\n进入Downloads页面，搜索microsoft R \n\n![pic5](serverpic/rserver5.jpg)\n\n选择最新版，也就是Microsoft R Server 9.1.0，选择跟你操作系统相匹配的版本，比如我选择Microsoft R Server 9.1.0 for Windows (x64) - (English) \n\n![pic6](serverpic/rserver6.jpg)\n\n如果你没有加入Visual Studio Dev Essentials，搜索的时候会看到下面的提示 \n\n![pic7](serverpic/rserver7.jpg)\n\n返回前面的步骤，加入就可以了。\n\n\n### 第三步：安装Microsoft R Server \n\n解压缩en_microsoft_r_server_910_for_windows_x64_10324119.zip文件，双击运行RServerSetup.exe启动安装程序。 \n在安装过程中，安装程序会自动去微软的服务器下载需要的组件，但是由于墙的阻隔，有些组件很难下载到.\n血清数据网已经将这三个组件打包上传到百度云盘，需要的话可以下载，链接: \u003chttp://pan.baidu.com/s/1bptNbER\u003e 密码: 73nm \n**【注：仅限于测试和学习使用，下载后请在24小时之内删除】**\n\n当你的网络不好，或者是因为在墙内，安装程序会长时间停留在下载的步骤，就像这样 \n\n![pic8](serverpic/rserver8.jpg)\n\n或者由于机器没联网，无法下载组件，这两种情况都要用离线安装的方式。提前下载并安装好Microsoft MPI 7.1，把SRO_3.3.3.0_1033.cab和MLM_9.1.0.0_1033.cab文件放到系统临时文件夹里，位置在C:\\Users\\用户名\\AppData\\Local\\Temp，需要你把用户名替换成自己的用户名，比如我的就是下面这样,回过来看安装程序，点击 Continue，可以看到安装包和安装条件；然后选择安装路径、勾选 Pre-trained \n![pic10](serverpic/rserver10.png)\n然后接受 License Agreement ，Continue，最后点击 Install 就可以安装了。 \n![pic11](serverpic/rserver11.png)\n\n\n\n","project_url":"https://awesome.ecosyste.ms/api/v1/projects/github.com%2Fdataxujing%2Finstall-r-rstudio-server-shiny-server-git","html_url":"https://awesome.ecosyste.ms/projects/github.com%2Fdataxujing%2Finstall-r-rstudio-server-shiny-server-git","lists_url":"https://awesome.ecosyste.ms/api/v1/projects/github.com%2Fdataxujing%2Finstall-r-rstudio-server-shiny-server-git/lists"}