{"id":23221518,"url":"https://github.com/g2bc/plasticome-backend","last_synced_at":"2026-01-23T14:43:58.912Z","repository":{"id":213345443,"uuid":"722744967","full_name":"G2BC/plasticome-backend","owner":"G2BC","description":null,"archived":false,"fork":false,"pushed_at":"2024-12-17T10:56:14.000Z","size":4497,"stargazers_count":0,"open_issues_count":1,"forks_count":1,"subscribers_count":1,"default_branch":"develop","last_synced_at":"2025-04-12T14:36:12.555Z","etag":null,"topics":[],"latest_commit_sha":null,"homepage":null,"language":"Python","has_issues":true,"has_wiki":null,"has_pages":null,"mirror_url":null,"source_name":null,"license":null,"status":null,"scm":"git","pull_requests_enabled":true,"icon_url":"https://github.com/G2BC.png","metadata":{"files":{"readme":"README.md","changelog":null,"contributing":null,"funding":null,"license":null,"code_of_conduct":null,"threat_model":null,"audit":null,"citation":null,"codeowners":null,"security":null,"support":null,"governance":null,"roadmap":null,"authors":null,"dei":null,"publiccode":null,"codemeta":null,"zenodo":null}},"created_at":"2023-11-23T21:06:41.000Z","updated_at":"2024-12-17T10:55:18.000Z","dependencies_parsed_at":null,"dependency_job_id":"a4f6c3d8-e955-4473-830a-c8d749cc5b8e","html_url":"https://github.com/G2BC/plasticome-backend","commit_stats":null,"previous_names":["g2bc/plasticome-backend"],"tags_count":3,"template":false,"template_full_name":null,"purl":"pkg:github/G2BC/plasticome-backend","repository_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/G2BC%2Fplasticome-backend","tags_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/G2BC%2Fplasticome-backend/tags","releases_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/G2BC%2Fplasticome-backend/releases","manifests_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/G2BC%2Fplasticome-backend/manifests","owner_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/owners/G2BC","download_url":"https://codeload.github.com/G2BC/plasticome-backend/tar.gz/refs/heads/develop","sbom_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories/G2BC%2Fplasticome-backend/sbom","scorecard":null,"host":{"name":"GitHub","url":"https://github.com","kind":"github","repositories_count":286080680,"owners_count":28694457,"icon_url":"https://github.com/github.png","version":null,"created_at":"2022-05-30T11:31:42.601Z","updated_at":"2026-01-23T14:15:13.573Z","status":"ssl_error","status_checked_at":"2026-01-23T14:09:05.534Z","response_time":59,"last_error":"SSL_connect returned=1 errno=0 peeraddr=140.82.121.6:443 state=error: unexpected eof while reading","robots_txt_status":"success","robots_txt_updated_at":"2025-07-24T06:49:26.215Z","robots_txt_url":"https://github.com/robots.txt","online":false,"can_crawl_api":true,"host_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub","repositories_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repositories","repository_names_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/repository_names","owners_url":"https://repos.ecosyste.ms/api/v1/hosts/GitHub/owners"}},"keywords":[],"created_at":"2024-12-18T22:17:12.773Z","updated_at":"2026-01-23T14:43:58.892Z","avatar_url":"https://github.com/G2BC.png","language":"Python","funding_links":[],"categories":[],"sub_categories":[],"readme":"[tag1-image]: https://img.shields.io/badge/-1.0.0-purple\n\n[python-image]:https://img.shields.io/badge/python-^3.10-yellow\n[blast-image]:https://img.shields.io/badge/blast-^2.15-gree\n[poetry-image]: https://img.shields.io/badge/poetry-^1.5.1-blue\n\n\n# 🍄 PLASTICOME 🍄\n![1.0.0][python-image] ![1.0.0][poetry-image] ![1.0.0][blast-image]\n### Essa é uma ferramenta para identificar genes que possuem a capacidade de degradar plástico no genoma de um fungo. Ela é composta por uma pelo back-end que se caracteriza por essa API, um front-end [plasticome-frontend](https://github.com/G2BC/plasticome-frontend), e uma api que lida com as informações a serem registradas/consultadas no banco de dados [plasticome-metadata](https://github.com/G2BC/plasticome-metadata)\n\n## 💙 Notas da desenvolvedora:\nEsse projeto foi desenvolvido em ambiente windows 10 com python 3.11, pode precisar de ajustes ao ser executado em um ambiente diferente\n\n### Versões\n\u003e![1.0.0][tag1-image] `07/11/2023`\n\u003e Plasticome funcionando apenas com dbCAN e ecPred, encontra muitas enzimas já que a comparação com a cazy family e ec numbers é bem ampla, mas já funciona!\n\n## 🔍Escolhas para o ambiente de desenvolvimento:\n\u003e ### Poetry\n\u003e O Poetry é uma ferramenta de gerenciamento de dependências e construção de projetos Python. Seu gerenciamento de dependências é completamente simplificado, garantindo que todas as dependências estejam documentadas em seu arquivo  [`pyproject.toml`](pyproject.toml), evitando a necessidade de criar um arquivo manual `requirements.txt. Além disso ele cria e gerencia ambientes virtuais automaticamente em cada projeto, e facilita a instalação e atualização de dependências.\n\u003e\n\u003e ### Pytest\n\u003e Além de oferecer uma abordagem simplificada e uma estrutura limpa que pode ser compreendida até por quem nunca mexeu com testes.\n\u003e\n\u003e ### Blue\n\u003e Blue é um formatador de código python que segue todas as convenções de boas práticas e organização de código lançadas na PEP8.\n\u003e\n\u003e ### iSort\n\u003eTembém para seguir a PEP8, o iSort gerencia e organiza os imports de todo o projeto.\n\u003e\n\u003e ### Taskipy\n\u003e Simplifica a forma de fazer comandos, por exemplo invés de lembrar todos os parâmetros pra rodar um teste (`test --v --cov=plasticome`) contruir uma automatização para rodar apenas `test`, e da mesma forma com os linters, docs e rodar a aplicação de fato.\n\n## 😎 Quero mexer nesse projeto preciso de que?\n1. Certifique-se de ter o python 3.10+\n2. Tenha o blast instalado e adicione o caminho para a pasta `\\bin` na variável de ambiente `BLAST_PATH`\n3. Tenha o gerenciador de pacotes do poetry instalado (pode usar outro e instalar as bibliotecas manualmente, mas recomendo fortemente o poetry)\n4. Crie o ambiente virtual do poetry na raiz do projeto com `poetry shell`\n5. Instale as dependências com `poetry install`\n6. Tenha o docker instalado, pois as imagens do Dbcan e ECPred precisam dele para executar.\n6. Duplique o arquivo [.env.example](/.env.example).\n7. Apaque o sufixo `.example` e preencha nessa arquivo todas as informações necessárias.\n7. Seja feliz e pode brincar com o plasticome!\n\n## 🔍 Comandos importantes para o desenvolvimento:\n`task - l`: Comando do taskipy para listar as tarefas configuradas\n\n`task lint`: Verifica se o código está seguindo as convenções da PEP8, usando blue e isort\n\n`task docs`: Serve a documentação\n\n`task teste`: Executa os testes da aplicação\n\n`task run`: Executa o servidor flask\n\n## 🧾 TO DO list para a eu do futuro:\n- [X] Adicionar o predição de `Ec numbers`\n- [ ] Melhorar  a documentação\n- [ ] Criar um container docker para publicar essa api online\n- [ ] Adicionar SignalP na esteira de análise\n","project_url":"https://awesome.ecosyste.ms/api/v1/projects/github.com%2Fg2bc%2Fplasticome-backend","html_url":"https://awesome.ecosyste.ms/projects/github.com%2Fg2bc%2Fplasticome-backend","lists_url":"https://awesome.ecosyste.ms/api/v1/projects/github.com%2Fg2bc%2Fplasticome-backend/lists"}