https://github.com/cookjohn/zotero-mcp

It's a plugin extension in Zotero. Zotero MCP Plugin enables integration between AI assistants and Zotero through MCP. Zotero MCP Plugin 是一个 Zotero 插件，通过 MCP协议实现 AI 助手与 Zotero深度集成。插件支持文献检索、元数据管理、全文分析和智能问答等功能，让 Claude、ChatGPT 等 AI 工具能够直接访问和操作您的文献库。
https://github.com/cookjohn/zotero-mcp
literature-review mcp-server zotero
Last synced: 24 days ago
JSON representation
Host: GitHub
URL: https://github.com/cookjohn/zotero-mcp
Owner: cookjohn
License: mit
Created: 2025-08-14T09:31:55.000Z (11 months ago)
Default Branch: main
Last Pushed: 2026-06-10T17:09:06.000Z (24 days ago)
Last Synced: 2026-06-10T19:06:46.084Z (24 days ago)
Topics: literature-review, mcp-server, zotero
Language: TypeScript
Homepage:
Size: 9.87 MB
Stars: 885
Watchers: 5
Forks: 68
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awesome-ChatGPT-repositories - zotero-mcp - Zotero MCP Plugin 是一个 Zotero 插件，通过 MCP协议实现 AI 助手与 Zotero深度集成。插件支持文献检索、元数据管理、全文分析和智能问答等功能，让 Claude、ChatGPT 等 AI 工具能够直接访问和操作您的文献库。 Zotero MCP Plugin enables integration between AI assistants and Zotero through MCP. (Browser-extensions)
README

          # Zotero MCP - Model Context Protocol Integration for Zotero

Zotero MCP 是一个开源项目，旨在通过模型上下文协议（Model Context Protocol, MCP）将强大的 AI 功能与领先的文献管理工具 Zotero 无缝集成，为 AI 助手（如 Claude）提供与您本地 Zotero 文献库交互的能力。

_This README is also available in: [:gb: English](./README.md) | :cn: 简体中文._

[![GitHub](https://img.shields.io/badge/GitHub-zotero--mcp-blue?logo=github)](https://github.com/cookjohn/zotero-mcp)

[![zotero target version](https://img.shields.io/badge/Zotero-7-green?style=flat-square&logo=zotero&logoColor=CC2936)](https://www.zotero.org)

[![Node.js](https://img.shields.io/badge/Node.js-18%2B-green)](https://nodejs.org)

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## 📚 项目概述

Zotero MCP 服务器是一个基于 Model Context Protocol 的工具服务器，它为 Claude Desktop 等 AI 应用提供了与 Zotero 文献管理系统的无缝集成。通过此服务器，AI 助手可以：

- 🔍 **智能搜索**：多维度搜索文献库（标题/作者/年份/标签/全文/语义），支持布尔运算和相关性评分

- 📖 **内容提取**：获取 PDF 全文、笔记、摘要、网页快照等多种内容，支持精细的模式控制

- 📝 **批注分析**：按颜色、标签、关键词检索和分析 PDF 高亮与注释

- 📂 **分类浏览**：浏览和搜索分类层级结构，获取分类下的条目

- 🧠 **语义搜索**：基于 AI 向量嵌入的概念匹配，发现跨语言的相关文献

- ✏️ **写入操作**：创建笔记、管理标签、更新元数据、创建新条目并关联附件

- 💾 **全文数据库**：访问和搜索缓存的 PDF 全文内容

这使得 AI 助手能够帮助您进行文献综述、引用管理、内容分析、批注整理、知识库管理等学术工作。

## 🚀 项目结构

本项目采用了**统一架构**，将 MCP 服务器集成在插件内：

- **`zotero-mcp-plugin/`**: 一个集成了 **MCP 服务器功能**的 Zotero 插件，使用 Streamable HTTP 协议直接与 AI 客户端通信

- **`IMG/`**: 截图和说明文档图片

- **`README.md`** / **`README-zh.md`**: 项目说明文档

**统一架构：**

```

AI 客户端 ↔ Streamable HTTP ↔ Zotero 插件（集成 MCP 服务器）

```

这种设计消除了对单独 MCP 服务器进程的需求，提供了更加简化和高效的集成方式。

---

## 🚀 快速上手指南

本指南旨在帮助普通用户快速配置和使用 Zotero MCP，让您的 AI 助手能够与 Zotero 文献库无缝协作。

### 1. 快速使用教程（面向普通用户）

**Zotero MCP 是什么？**

简单来说，Zotero MCP 是一座桥梁，它连接了您的 AI 客户端（如 Cherry Studio, Gemini CLI, Claude Desktop 等）和本地的 Zotero 文献管理软件。通过它，AI 助手可以直接搜索、查询和引用您 Zotero 库中的文献，极大地提升学术研究和写作效率。

**两步快速开始：**

1.  **安装插件**：

    *   前往项目的 [Releases 页面](https://github.com/cookjohn/zotero-mcp/releases) 下载最新的 `zotero-mcp-plugin-x.x.x.xpi` 文件。

    *   在 Zotero 中，通过 `工具 -> 附加组件` 安装该 `.xpi` 文件。

    *   重启 Zotero。

2.  **配置插件**：

    *   在 Zotero 的 `首选项 -> Zotero MCP Plugin` 标签页中：

        - **启用服务器**：勾选此选项启动集成的 MCP 服务器

        - **端口设置**：默认为 `23120`（可根据需要修改）

        - **生成客户端配置**：点击此按钮获取适用于您 AI 客户端的配置代码

    *   将生成的配置代码复制到您的 AI 客户端配置文件中

配置完成后，您就可以在 AI 助手中通过自然语言与您的 Zotero 文献库进行交互了。

**配置示例（Claude Desktop）：**

```json

{

  "mcpServers": {

    "zotero": {

      "transport": "streamable_http",

      "url": "http://127.0.0.1:23120/mcp"

    }

  }

}

```

**使用示例:**

-   `"帮我查找一下我的 Zotero 库里所有关于"人工智能"的文献"`

-   `"获取去年由 Hinton 发表的关于 transformer 的期刊文章"`

-   `"查找 DOI 为 10.1038/nature14539 的文献"`

---

### 2. 连接 AI 客户端

**重要**：Zotero 插件现在包含了**集成的 MCP 服务器**，使用 Streamable HTTP 协议。无需安装单独的服务器。

#### Streamable HTTP 连接

插件使用 Streamable HTTP 协议，支持与 AI 客户端的实时双向通信：

1. 在 Zotero 插件设置中**启用服务器**

2. 点击**生成客户端配置**按钮

3. 将生成的配置**复制到您的 AI 客户端**

#### 支持的 AI 客户端

- **Claude Desktop**: Streamable HTTP MCP 支持

- **Cherry Studio**: Streamable HTTP 支持

- **Cursor IDE**: Streamable HTTP MCP 支持

- **自定义实现**: Streamable HTTP 协议

### 验证与故障排查

配置完成后，如何确认一切正常工作？

**1. 验证连接**

*   **查看客户端状态**：大多数 AI 客户端（如 ChatBox, Cherry Studio）的 MCP 配置界面会显示服务器的连接状态。如果显示为 "Connected" 或绿色指示灯，说明连接已成功建立。

*   **使用测试命令**：在 AI 助手的聊天框中，发送一个简单的测试命令，例如：

    `"使用 zotero 工具查找任何文献，返回一条即可"`

    如果 AI 能够调用 `zotero.search_library` 并返回结果，说明整个链路已通。

**2. 故障排查指南**

如果连接失败或工具不工作，请按以下步骤排查：

| 步骤 | 检查项 | 解决方案 |

| :--- | :--- | :--- |

| **1** | **Zotero 插件服务** | 确保 Zotero 正在运行，并且在 `首选项 -> Zotero MCP Plugin` 中，"Enable Server" 已被勾选。 |

| **2** | **路径配置** | 确认 AI 客户端中的 `command` 设置为 `node`，并且作为参数的 `index.js` **绝对路径**完全正确。路径错误是导致失败的最常见原因。 |

| **3** | **端口冲突** | 如果 Zotero 插件端口 `23119` 被占用，请在插件设置中更换端口，并在 `zotero-mcp-server` 目录下创建 `.env` 文件，内容为 `ZOTERO_API_PORT=新端口号`。 |

| **4** | **查看日志** | 大多数客户端都提供 MCP 服务器的日志输出功能。在 MCP 配置界面寻找 "Show Logs" 或类似的按钮。日志是定位问题的最有效工具，通常会明确指出是路径错误、命令失败还是其他问题。 |

| **5** | **防火墙/安全软件** | 确认您的防火墙或安全软件没有阻止 `node.exe` (Windows) 或 `node` (macOS/Linux) 的网络通信。 |

| **6** | **环境依赖** | 确保您的系统中已安装 Node.js (版本 18+)。您可以在终端中运行 `node -v` 来检查版本。 |

**3. 常见错误信息**

*   **`command not found` 或 `spawn ENOENT`**: 通常表示 `node` 命令不存在或路径错误。请检查 Node.js 是否已正确安装并加入了系统环境变量，或者检查客户端配置中的命令是否正确。

*   **`Error: connect ECONNREFUSED 127.0.0.1:23119`**: 表示 MCP 服务器无法连接到 Zotero 插件。请执行上述排查指南的第 1 步和第 3 步。

*   **JSON 格式错误**: 在手动编辑配置文件时，请确保您的 JSON 语法正确，没有遗漏逗号或括号。

如果以上步骤均无法解决问题，请前往 [GitHub Issues](https://github.com/cookjohn/zotero-mcp/issues) 页面，并附上您的操作系统、客户端版本和相关的日志信息，以便我们更好地帮助您。

---

## 🧩 插件功能特性

`zotero-mcp-plugin` 是一个集成了 MCP 服务器功能的 Zotero 插件，直接与 AI 客户端通信。

### 主要功能

-   **集成 MCP 服务器**: 内置 MCP 服务器，使用 Streamable HTTP 协议，无需额外进程

-   **高级搜索引擎**: 支持全文搜索、布尔运算、相关性评分，按标题、作者、年份、标签、文献类型等多维度筛选

-   **统一内容提取**: 从 PDF、附件、笔记、摘要、网页快照中提取内容，支持四种模式（minimal/preview/standard/complete）

-   **智能批注系统**: 按颜色、标签、关键词搜索和检索 PDF 高亮、注释和笔记，支持智能排序

-   **分类管理**: 浏览、搜索分类层级结构，获取分类详情、子分类和条目列表

-   **语义搜索**: 基于 AI 向量嵌入的语义搜索，支持 OpenAI/Ollama API，发现概念相关的文献

-   **写入功能**: 创建/修改笔记、管理标签、更新元数据字段、创建新条目并关联独立 PDF

-   **全文数据库**: 缓存的 PDF 全文数据库，支持列表、搜索、获取和统计操作

-   **独立附件管理**: 搜索和管理只有 PDF 没有元数据信息的独立条目

-   **客户端配置生成器**: 自动为各种 AI 客户端生成配置

-   **安全性**: 仅本地操作，确保数据完全隐私

-   **用户友好**: 通过 Zotero 首选项界面轻松配置

---

## 效果展示

这里是一些展示 Zotero MCP 功能的截图：

| 功能 | 截图 |

| :--- | :---: |

| **功能说明** | ![功能说明](./IMG/功能说明.png) |

| **文献检索** | ![文献检索](./IMG/文献检索.png) |

| **元数据查看** | ![元数据查看](./IMG/元数据查看.png) |

| **全文读取 1** | ![全文读取 1](./IMG/全文读取1.png) |

| **全文读取 2** | ![全文读取 2](./IMG/全文读取2.png) |

| **附件检索 (Gemini CLI)** | ![附件检索](./IMG/geminicli-附件检索.png) |

| **PDF 读取 (Gemini CLI)** | ![PDF 读取](./IMG/geminicli-pdf读取.png) |

---

## 👨‍💻 开发者安装指南

### 前置要求

- **Zotero** 7.0 或更高版本

- **Node.js** 18.0 或更高版本（仅用于开发）

- **npm** 或 **yarn** 包管理器（仅用于开发）

- **Git**（仅用于开发）

### 步骤 1: 安装和配置 Zotero 插件

1. 前往项目的 [Releases 页面](https://github.com/cookjohn/zotero-mcp/releases) 下载最新的 `zotero-mcp-plugin-x.x.x.xpi` 文件

2. 在 Zotero 中，通过 `工具 -> 附加组件` 安装该 `.xpi` 文件

3. 在 Zotero 的 `首选项 -> Zotero MCP Plugin` 标签页中，配置服务器设置：

   - **启用服务器**：启动集成的 MCP 服务器

   - **端口设置**：默认为 `23120`

   - **生成客户端配置**：点击按钮获取适用于您 AI 客户端的配置

### 步骤 2: 开发环境设置（可选）

如果您想要修改或开发插件，可以按照以下步骤设置开发环境：

1. 克隆本仓库到本地：

   ```bash

   git clone https://github.com/cookjohn/zotero-mcp.git

   cd zotero-mcp

   ```

2. 设置插件开发环境：

   ```bash

   cd zotero-mcp-plugin

   npm install

   npm run build

   ```

3. 在 Zotero 中加载插件：

   ```bash

   # 开发模式（自动重载）

   npm run start

   

   # 或手动安装构建后的 .xpi 文件

   npm run build

   ```

### 步骤 3: 连接 AI 客户端

插件包含了集成的 MCP 服务器，使用 Streamable HTTP 协议：

**Streamable HTTP 连接示例（Claude Desktop）：**

1. 找到 Claude Desktop 配置文件：

   - **Windows**: `%APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json`

   - **macOS**: `~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json`

   - **Linux**: `~/.config/Claude/claude_desktop_config.json`

2. 编辑配置文件：

   ```json

   {

     "mcpServers": {

       "zotero": {

         "transport": "streamable_http",

         "url": "http://127.0.0.1:23120/mcp"

       }

     }

   }

   ```

3. 重启 Claude Desktop 应用

### 步骤 4: 开始使用

配置完成后，您就可以在 AI 助手中通过自然语言与您的 Zotero 文献库进行交互了。

**示例:**

-   `"帮我查找一下我的 Zotero 库里所有关于“人工智能”的文献"`

-   `"获取去年由 Hinton 发表的关于 transformer 的期刊文章"`

-   `"查找 DOI 为 10.1038/nature14539 的文献"`

---

## 👨‍💻 开发者文档

### 技术架构

```

┌─────────────┐  Streamable HTTP  ┌──────────────────────────────┐

│ AI 客户端    │ <--------------> │ Zotero 插件（集成 MCP 服务器） │

│ (Claude, etc) │                   │ + 内置API + 数据访问        │

└─────────────┘                   └──────────────────────────────┘

```

1. **AI 客户端** 通过 Streamable HTTP 协议直接与插件通信

2. **Zotero 插件** 内置 MCP 服务器，处理 MCP 请求并调用 Zotero API

3. **数据处理** 在插件内部完成，无需额外进程

4. **响应返回** 直接发送给 AI 客户端

### 插件开发

1. 进入插件目录并安装依赖：

   ```bash

   cd zotero-mcp-plugin

   npm install

   ```

   

2. 启动开发模式：

   ```bash

   npm start

   ```

   这将启动 Zotero 并自动加载插件。代码更改时会自动重载。

3. 构建插件 `.xpi` 文件：

   ```bash

   npm run build

   ```

### MCP 服务器开发

MCP 服务器已集成在插件内，位于 `src/modules/streamableMCPServer.ts`。主要功能：

- Streamable HTTP 连接管理

- MCP 协议处理

- 工具调用路由

- 错误处理和日志记录

---

## 🔧 API 参考（MCP 工具列表）

插件集成的 MCP 服务器提供以下 **20 个工具**，分为 5 大类：

### 一、搜索与查询（7 个）

#### `search_library`

高级文献库搜索，支持多维度筛选、布尔运算、相关性评分和智能模式控制。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `q` | string | 通用搜索关键词 |

| `title` | string | 标题搜索（支持 `titleOperator`: contains/exact/startsWith/endsWith/regex） |

| `yearRange` | string | 年份范围（如 "2020-2023"） |

| `fulltext` | string | 全文搜索（附件/笔记内容），支持 `fulltextMode`: attachment/note/both |

| `itemType` | string | 文献类型筛选（journalArticle/book/attachment 等） |

| `includeAttachments` | string | 设为 "true" 可搜索独立 PDF 条目 |

| `mode` | string | 处理模式：minimal(30)/preview(100)/standard(自适应)/complete(500+) |

| `relevanceScoring` | boolean | 启用相关性评分 |

| `sort` | string | 排序：relevance/date/title/year |

| `limit` / `offset` | number | 分页控制 |

#### `search_annotations`

按关键词、颜色或标签搜索批注，支持智能排序和相关性过滤。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `q` | string | 搜索关键词（与 colors/tags 至少提供一个） |

| `itemKeys` | string[] | 限定搜索范围到指定条目 |

| `types` | string[] | 批注类型：note/highlight/annotation/ink/text/image |

| `colors` | string[] | 按颜色过滤（支持色名或 hex：yellow/red/green/blue/purple/orange） |

| `tags` | string[] | 按标签过滤 |

| `mode` | string | 内容处理模式 |

#### `search_fulltext`

在所有文档全文中搜索，返回上下文片段和相关性评分。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `q` | string | **必需**，搜索关键词 |

| `itemKeys` | string[] | 限定搜索范围 |

| `mode` | string | 处理模式 |

| `contextLength` | number | 匹配上下文长度 |

| `caseSensitive` | boolean | 区分大小写 |

#### `search_collections`

按名称搜索分类。参数：`q`（搜索词）、`limit`（最大结果数）。

#### `get_item_details`

获取单个文献的完整元数据（作者、日期、DOI、标签、附件、笔记等）。参数：`itemKey`（必需）、`mode`。

#### `get_item_abstract`

获取条目的摘要/简介。参数：`itemKey`（必需）、`format`（json/text）。

#### `get_content`

统一内容提取工具：从条目或附件中获取 PDF 全文、笔记、摘要、网页快照等。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `itemKey` | string | 条目 Key（获取该条目下所有内容） |

| `attachmentKey` | string | 附件 Key（获取特定附件内容） |

| `mode` | string | minimal(500字符)/preview(1.5K)/standard(3K)/complete(无限制) |

| `include` | object | 控制包含哪些内容：pdf/attachments/notes/abstract/webpage |

| `contentControl` | object | 高级内容控制（preserveOriginal/allowExtended/maxContentLength 等） |

| `format` | string | 输出格式：json（结构化）或 text（纯文本） |

### 二、分类管理（4 个）

#### `get_collections`

获取文献库中所有分类列表。参数：`mode`、`limit`、`offset`。

#### `get_collection_details`

获取特定分类的详细信息。参数：`collectionKey`（必需）。

#### `get_collection_items`

获取指定分类中的条目列表。参数：`collectionKey`（必需）、`limit`、`offset`。

#### `get_subcollections`

获取子分类列表。参数：`collectionKey`（必需）、`limit`、`offset`、`recursive`（是否递归）。

### 三、语义搜索（3 个，可在偏好设置中禁用）

#### `semantic_search`

基于 AI 向量嵌入的语义搜索，即使没有精确关键词匹配也能找到概念相关的内容。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `query` | string | **必需**，自然语言查询（如 "机器学习在医疗中的应用"） |

| `topK` | number | 返回结果数量（默认 10） |

| `minScore` | number | 最低相似度（0-1，默认 0.3） |

| `language` | string | 语言过滤：zh/en/all |

#### `find_similar`

基于指定条目发现语义相似的文献。参数：`itemKey`（必需）、`topK`、`minScore`。

#### `semantic_status`

查看语义搜索服务的状态、索引统计和覆盖率。无需参数。

### 四、全文数据库（1 个）

#### `fulltext_database`

访问缓存的全文内容数据库（只读）。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `action` | string | **必需**：list（列表）/search（搜索）/get（获取）/stats（统计） |

| `query` | string | 搜索关键词（search 操作必需） |

| `itemKeys` | string[] | 指定条目（get 操作） |

| `limit` | number | 最大结果数 |

### 五、写入操作（4 个，可在偏好设置中禁用）

#### `write_note`

创建或修改 Zotero 笔记，支持 Markdown 自动转换为 HTML。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `action` | string | **必需**：create/update/append |

| `parentKey` | string | 关联到指定条目（create 时可选，省略则创建独立笔记） |

| `noteKey` | string | 已有笔记 Key（update/append 必需） |

| `content` | string | **必需**，笔记内容（Markdown 或 HTML） |

| `tags` | string[] | 添加标签 |

#### `write_tag`

添加、移除或替换条目上的标签。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `action` | string | **必需**：add（追加）/remove（移除）/set（替换全部） |

| `itemKey` | string | **必需**，条目 Key |

| `tags` | string[] | **必需**，标签列表 |

#### `write_metadata`

更新条目的元数据字段（标题、摘要、日期、DOI、作者等）。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `itemKey` | string | **必需**，条目 Key |

| `fields` | object | 要更新的字段（title/abstractNote/date/url/DOI/language 等） |

| `creators` | array | 替换作者列表，每项包含 creatorType/firstName/lastName 或 name |

#### `write_item`

创建新的文献条目或重新关联附件。

| 参数 | 类型 | 描述 |

|---|---|---|

| `action` | string | **必需**：create（创建条目）/reparent（移动附件） |

| `itemType` | string | 条目类型（journalArticle/book/conferencePaper/thesis 等） |

| `fields` | object | 元数据字段 |

| `creators` | array | 作者列表 |

| `tags` | string[] | 标签 |

| `attachmentKeys` | string[] | 要关联的独立附件 Key 列表 |

| `parentKey` | string | reparent 操作的目标父条目 Key |

---

## 🐛 常见问题 (FAQ)

#### 1. 连接被拒绝错误

**问题**: `Error: connect ECONNREFUSED 127.0.0.1:PORT`

**解决方案**:

- 确保 Zotero 正在运行

- 检查 Zotero 插件是否已启用

- 在插件设置中检查服务器是否已启用

- 确认端口号（默认 23120）与 AI 客户端配置一致

#### 2. Streamable HTTP 连接失败

**问题**: `Streamable HTTP connection failed`

**解决方案**:

- 确保在插件设置中启用了服务器

- 检查防火墙设置，允许 Zotero 进行网络通信

- 确认 URL 格式正确：`http://127.0.0.1:23120/mcp`

#### 3. Claude Desktop 无法识别工具

**问题**: Claude 不显示 Zotero 相关工具

**解决方案**:

- 检查 `claude_desktop_config.json` 中的配置是否正确

- 确保使用了 `"transport": "streamable_http"` 配置

- 确保 JSON 格式正确

- 重启 Claude Desktop 应用

#### 4. 插件服务器无法启动

**问题**: 插件设置显示服务器启动失败

**解决方案**:

- 检查端口是否被占用，尝试更换端口

- 重启 Zotero 应用

- 查看 Zotero 错误控制台（`工具 -> 开发者 -> 错误控制台`）

---

## 🤝 贡献指南

欢迎贡献代码、报告问题或提出建议！

1.  Fork 本仓库。

2.  创建您的功能分支 (`git checkout -b feature/AmazingFeature`)。

3.  提交您的更改 (`git commit -m 'Add some AmazingFeature'`)。

4.  推送到分支 (`git push origin feature/AmazingFeature`)。

5.  开启一个 Pull Request。

## 📄 许可证

本项目采用 [MIT License](./LICENSE) 授权。

## 🙏 致谢

- [Zotero](https://www.zotero.org/) - 优秀的开源文献管理工具。

- [Model Context Protocol](https://modelcontextprotocol.org/) - 实现 AI 工具集成的协议。

- [![Using Zotero Plugin Template](https://img.shields.io/badge/Using-Zotero%20Plugin%20Template-blue?style=flat-square&logo=github)](https://github.com/windingwind/zotero-plugin-template)
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