https://github.com/duartebred/algoritmos-avancados-bioinformatica

Repositório para apresentação de código desenvolvido pelo grupo 2 para a UC Algoritmos Avançados para a Bioinformática do Mestrado em Bioinformática, ano lectivo 23-24.
https://github.com/duartebred/algoritmos-avancados-bioinformatica

alinhamento automata biological-networks bwt evolutionary-computation genome-assembly gibbs-sampling gibbs-sampling-algorithm grafos motifs suffix-tree tries

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Repositório para apresentação de código desenvolvido pelo grupo 2 para a UC Algoritmos Avançados para a Bioinformática do Mestrado em Bioinformática, ano lectivo 23-24.

• Host: GitHub
• URL: https://github.com/duartebred/algoritmos-avancados-bioinformatica
• Owner: duartebred
• Created: 2024-02-28T10:54:17.000Z (10 months ago)
• Default Branch: main
• Last Pushed: 2024-06-12T21:44:07.000Z (6 months ago)
• Last Synced: 2024-11-05T11:11:06.749Z (about 2 months ago)
• Topics: alinhamento, automata, biological-networks, bwt, evolutionary-computation, genome-assembly, gibbs-sampling, gibbs-sampling-algorithm, grafos, motifs, suffix-tree, tries
• Language: Python
• Homepage: https://github.com/duartebred/Algoritmos-Avancados-para-a-Bioinformatica-GX-MBI2023-24
• Size: 248 KB
• Stars: 1
• Watchers: 2
• Forks: 0
• Open Issues: 0
• Metadata Files:
  • Readme: README.md

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README

        
# Algoritmos Avançados para a Bioinformática, 2023/24

**Grupo 2**

Repositório criado por:

- [André Ramos](https://github.com/andrefiliperamos) (pg27665)

- [Duarte Velho](https://github.com/duartebred) (pg53841)

- [Joana Lopes](https://github.com/joanalopes0711) (pg53498)

- [João Ferreira](https://github.com/B-Neil) (pg52182)

- [Ricardo Oliveira](https://github.com/ricardofoliveira61) (pg53501)

**Algoritmos construídos**

- Motifs: Gibbs sampling

- Computação evolucionária

- Procura de padrões: Autómatos finitos; Tries; Árvores de sufixos

- Alinhamentos contra referências (BWTs)

- Grafos

- Redes biológicas



Este repositório foi criado no ambito da UC Algoritmos Avançados para a Bioinformática (2023/24), do Mestrado em Bioinformática da Escola de Engenharia da Universidade do Minho, e tem como objetivo reunir os scripts construídos ao longo da realização do trabalho. 

Neste repositório são apresentadas as implementações dos algoritmos leccionados no âmbito da UC. No código presente neste portfólio, encontra-se a documentação do código, Type hinting, Unit tests e todas as fontes onde se foi buscar código.


Este repositório destaca-se pela originalidade e a autoria do código escrito.

**Docente**

Trabalho proposto pelo docente [Rui Mendes](https://github.com/rcm).