Ecosyste.ms: Awesome
An open API service indexing awesome lists of open source software.
https://github.com/iago-farias/pairwise-global
Needleman–Wunsch algorithm implemented in JavaScript.
https://github.com/iago-farias/pairwise-global
ejs javascript nodejs
Last synced: 15 days ago
JSON representation
Needleman–Wunsch algorithm implemented in JavaScript.
- Host: GitHub
- URL: https://github.com/iago-farias/pairwise-global
- Owner: iago-farias
- Created: 2020-09-15T15:14:48.000Z (over 4 years ago)
- Default Branch: master
- Last Pushed: 2020-09-15T15:50:41.000Z (over 4 years ago)
- Last Synced: 2024-12-11T14:11:51.509Z (2 months ago)
- Topics: ejs, javascript, nodejs
- Language: JavaScript
- Homepage:
- Size: 24.4 KB
- Stars: 0
- Watchers: 1
- Forks: 0
- Open Issues: 0
-
Metadata Files:
- Readme: README.md
Awesome Lists containing this project
README
# Pairwise Global Alignment
Implementação do algoritmo de ***Needleman–Wunsch***, realizada durante o curso de Ciência da Computação no Instituto Federal de Brasília, como uma atividade da
disciplina de Introdução a Bioinformática.O programa recebe como entrada um arquivo ***sequences.fasta*** contendo duas sequências de aminoácidos ou nucleotídeos,
e retorna como resultado a tabela de programação dinâmica e um alinhamento ótimo. É criado também um arquivo em pdf para
melhor visualização dos resultados.# Como usar
1 - Rode o comando no terminal para instalar as dependências:```
npm install
```2 - Depois rode o comando no terminal para executar o programa:
```
node index.js
```> É necessário ter o arquivo sequences.fasta na raiz do projeto com a mesma formatação do arquivo de exemplo neste repositório.