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https://github.com/leouieda/ferramentas_ciencia_aberta

Material para demonstração do seminario "Ferramentas para ciência aberta" ministrado nos Palestras Estudantis
https://github.com/leouieda/ferramentas_ciencia_aberta

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Material para demonstração do seminario "Ferramentas para ciência aberta" ministrado nos Palestras Estudantis

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README 

        
# Ferramentas para ciência aberta



Seminário apresentado nas Palestras Estudantis do

[Observatório Nacional](http://on.br).



Esse repositório contém um molde para produzir um artigo:

* diretório `notebook` contém [IPython notebook](http://ipython.org/notebook.html) para fazer a análise dos dados e gerar figuras

* `dados` contém os dados utilizados na análise

* `presentation` contém slides de uma apresentação sobre ferramentas para ciência

* `manuscript.tex` inclui as figuras geradas pelos notebooks

* `Makefile` compila o `.tex`



A idéia é que cada artigo tenha um repositório

com tudo necessário para a reprodução dos resultados.

Esse repositório pode ser citado no artigo final.

Produtos extras que não são incluídos no artigo

(slides, poster, figuras, texto, videos, dados)

podem ser colocados no [figshare](http://www.figshare.com) e citados no artigo.



# Resumo do seminário



O processo científico produz muito mais do que é eventualmente publicado em

revistas. Fazer pesquisa involve geração de dados, código, análise, figuras,

pôster/apresentações, etc. No entanto, somente uma fração pequena disso é

publicada e geralmente exclui resultados considerados "negativos". Isso leva

uma grande reprodução de trabalho para descobrir o que "não funciona", já que

esses resultados nunca alcaçam a comunidade científica. Além disso, a

publicação geralmente ocorre através de documentos estáticos (PDF) que parecem

até pré-históricos quando comparados ao que estamos acostumados no mundo

interativo da internet. O movimento para maior abertura do processo científico

(open-science) tem promovido o uso de tecnologias emergentes para facilitar a

publicação imediata de todos os produtos de uma pesquisa. Alguns prestadores de

serviços se destacam dentre as várias opções disponíveis. O GitHub é o mais

popular serviço de hospedagem de código e colaboração. Para a linguagem de

programação Python, o IPython notebook permite a integração de código, texto,

tabelas e figuras em um único documento. A página figshare.com rapidamente se

tornou o padrão para publicação de dados, figuras, apresentações, material

suplementar, videos, etc. Nesta apresentação, falarei sobre como utilizar esses

serviços e as vantagens e de tornar sua pesquisa mais aberta e reprodutível.



# Links



Inspiração: http://youtu.be/7FIjpuwE0BQ



Slides (PDF): http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.774537



Notebook com análise no nbviewer: http://nbviewer.ipython.org/urls/raw.github.com/leouieda/ferramentas_ciencia_aberta/master/notebook/analise.ipynb



# Blogs para seguir



[Living in an ivory basement](http://ivory.idyll.org/blog/)



[Agile Geoscience](http://www.agilegeoscience.com/)



[Perlstein Lab](http://www.perlsteinlab.com/)



[Carl Boettiger's lab notebook](http://carlboettiger.info/lab-notebook.html)



[Green tea and velociraptors](http://blogs.egu.eu/palaeoblog/)



[AstroBetter](http://www.astrobetter.com/)



[it is NOT junk](http://www.michaeleisen.org/blog/)



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