https://github.com/mathieu2301/projet-bioinfo
https://github.com/mathieu2301/projet-bioinfo
bioinformatics dna-alignment dna-processing dna-sequences dna-sequencing
Last synced: 2 months ago
JSON representation
- Host: GitHub
- URL: https://github.com/mathieu2301/projet-bioinfo
- Owner: Mathieu2301
- Created: 2021-11-17T23:02:24.000Z (over 3 years ago)
- Default Branch: main
- Last Pushed: 2021-12-10T11:45:36.000Z (over 3 years ago)
- Last Synced: 2025-01-15T13:30:20.939Z (4 months ago)
- Topics: bioinformatics, dna-alignment, dna-processing, dna-sequences, dna-sequencing
- Language: Shell
- Homepage:
- Size: 16 MB
- Stars: 2
- Watchers: 3
- Forks: 0
- Open Issues: 0
-
Metadata Files:
- Readme: README.md
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README
## Introduction
L'énoncé complet du projet se trouve dans le fichier `./Sujet.pdf`.
Le projet s'organise en un seul fichier `2.ipynb` dont le nom correspond au numéro de notre groupe.
## Nécessités
Version de Python: 3.9
Il est nécessaire d'installer BioPython:
```pip install biopython```
et [MAFFT](https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/) si vous n'êtes **PAS** sur Windows.
## Recommandations
Je recommande l'utilisation des extensions VSCode `Jupyter` et `PDF Reader`.
Merci de placer tous les fichiers de séquences dans le dossier `./sequences` prévu.
Il est important de commenter chaque ligne pour l'évaluation.