https://github.com/nathadriele/genotrack-genomic-phenotypic-data-validation-system
GenoTrack é um sistema teste para controle, validação e visualização de dados genéticos e fenotípicos de pacientes, voltado para estudos de genômica.
https://github.com/nathadriele/genotrack-genomic-phenotypic-data-validation-system
automated-testing bdd-tests css3 e2e-tests framework genomic-data-analysis genotrack html5 javascript newman-reporter phenotypic-data postgresql postman robot rspec ruby-on-rails simplecov
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GenoTrack é um sistema teste para controle, validação e visualização de dados genéticos e fenotípicos de pacientes, voltado para estudos de genômica.
- Host: GitHub
- URL: https://github.com/nathadriele/genotrack-genomic-phenotypic-data-validation-system
- Owner: nathadriele
- Created: 2025-07-20T00:03:21.000Z (11 months ago)
- Default Branch: main
- Last Pushed: 2025-07-20T00:22:25.000Z (11 months ago)
- Last Synced: 2025-08-14T00:04:15.711Z (10 months ago)
- Topics: automated-testing, bdd-tests, css3, e2e-tests, framework, genomic-data-analysis, genotrack, html5, javascript, newman-reporter, phenotypic-data, postgresql, postman, robot, rspec, ruby-on-rails, simplecov
- Language: Ruby
- Homepage:
- Size: 44.9 KB
- Stars: 1
- Watchers: 0
- Forks: 0
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-
Metadata Files:
- Readme: README.md
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## 🧬 GenoTrack - Genomic & Phenotypic Data Validation System
GenoTrack é um sistema teste para controle, validação e visualização de dados genéticos e fenotípicos de pacientes, voltado para estudos de genômica.
### Funcionalidades Principais
- Registro Seguro: Captura de dados genômicos e fenotípicos com múltiplas validações automáticas.
- Consulta Eficiente: Busca por gene, ID e fenótipo com navegação intuitiva.
- Validação HPO: Compatível com a Human Phenotype Ontology (HPO).
- Integração Genótipo-Fenótipo: Checagem cruzada de genes, cromossomos e fenótipos.
- Testes Automatizados: Cobertura de testes ≥80% com validação em tempo real.
### Caso de Uso Destacado
```
Paciente: BR-PACIENTE-0321
Pesquisadora: Ana Silva
Gene: LDLR (localizado no cromossomo 19)
Fenótipo: HP:0003124 (hipercolesterolemia familiar)
Fluxo Validado:
Cadastro → Validação de Código → Gene ↔ Cromossomo ↔ Fenótipo → Visualização
```
### Stack Tecnológica
### Backend
```
Ruby on Rails – API REST
RSpec – Testes unitários
PostgreSQL – Banco de dados
```
### Frontend
```
HTML5 / CSS3 / JavaScript – Interface responsiva
Cypress – Testes ponta a ponta (E2E)
```
### Qualidade e Testes
```
Postman/Newman – Testes de API
Robot Framework – Testes BDD
SimpleCov – Cobertura de código
```
#### Execução Rápida
```
# Backend
cd backend && bundle install && rails server
# Frontend
cd frontend && npm install && npm start
# Testes
bundle exec rspec # Testes unitários
npm run cypress:run # Testes E2E
robot tests/robot/ # Testes BDD
```
### Validações Implementadas
- Código HPO com formato HP:000XXXX
- Paciente deve ter ao menos um gene e um fenótipo
- Consistência gene ↔ cromossomo
- Prevenção de duplicidade de fenótipos
- Várias regras de tipagem e integridade relacional
### Cobertura e Métricas de Teste
- Testes BDD – Robot Framework
- Testes de API – Newman/Postman
- Testes End-to-End – Cypress
- Testes Unitários – RSpec
### Testes RSpec
### Testes API NewmanPostman
### Testes BDD Robot Framework
### Testes E2E Cypress
### Métricas de Qualidade
- Cobertura de código: ≥ 80%
- Resposta média da API: < 200ms
- Testes automatizados e rastreáveis
- Interface com validações em tempo real