https://github.com/normalhuman01/pacha

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• Host: GitHub
• URL: https://github.com/normalhuman01/pacha
• Owner: normalhuman01
• License: bsd-3-clause
• Created: 2023-12-17T04:10:50.000Z (over 2 years ago)
• Default Branch: main
• Last Pushed: 2023-12-17T04:17:16.000Z (over 2 years ago)
• Last Synced: 2025-02-01T12:45:29.135Z (over 1 year ago)
• Language: C++
• Size: 109 KB
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• Metadata Files:
  • Readme: README.md
  • License: LICENSE

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README

          
### PACHA: Software para la Alineación de Grafos Químicos

**Descripción:**

PACHA es una herramienta de software para alinear grafos químicos.

**Uso:**

- Para utilizar PACHA, dirígete al directorio 'pacha/src', ejecuta 'make' y luego corre './pacha --input_file=string --output_file=string [opciones] ...'.

- Las opciones incluyen:

  - -i, --input_file: Nombre del archivo de entrada (cadena)

  - -o, --output_file: Nombre del archivo de salida (cadena)

  - -d, --dist: Distancia máxima para calcular características de vértices (entero largo sin signo [=5])

  - -k, --topk: Número de alineaciones a partir de pares de vértices con las mejores puntuaciones coincidentes (entero largo sin signo [=10])

  - -n, --num_threads: Número de hilos (entero largo sin signo [=1])

  - -t, --threshold: Umbral (flotante [=0])

  - -c, --inter_cuts: Número máximo de cortes intermoleculares (entero largo sin signo [=100000000])

  - -a, --intra_cuts: Número máximo de cortes intramoleculares (entero largo sin signo [=100000000])

  - -?, --help: Imprimir este mensaje

**Requisitos:**

- Compilador GNU C++ (Versiones superiores son preferibles para multi-hilos).

**Instalación:**

- Para instalar PACHA, ve al directorio 'pacha/src' y ejecuta 'make'.

**Licencia:** Licencia MIT