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Link collection for numerical analysis
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URL: https://github.com/ohno/links
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          # 数値計算リンク集

数値計算に関連するリンク集を作成しました. [こちら](https://ohno.github.io/links/)でHTML形式で閲覧できます.

おすすめのリンクがあったら[こちら](https://github.com/ohno/Links/issues)で教えてください.

## 数値計算入門

### 数値計算アニメーション

- [@ceptree](https://twitter.com/i/events/974005849608798208)

- [@EADGCGDA](https://twitter.com/i/events/1146083710006988800)

- [molecules in the box](http://mike1336.web.fc2.com/)

### 解説記事

- [シキノート](https://slpr.sakura.ne.jp/qp/home/program/)

- [@genkuroki](https://gist.github.com/genkuroki)

- [@cometscome_phys](https://qiita.com/cometscome_phys)

- [Qiita](https://qiita.com/tags/%e6%95%b0%e5%80%a4%e8%a8%88%e7%ae%97)

### 講義

- [Computational Physics (Rutgers University)](http://www.physics.rutgers.edu/grad/509/)

- [Introduction to Computational Physics (University of Vienna)](https://homepage.univie.ac.at/franz.vesely/cp_tut/nol2h/new/)

- [Computational Physics (The University of Texas at Austin)](http://farside.ph.utexas.edu/teaching/329/lectures/lectures.html)

- [Computational Physics (Oregon State University)](http://sites.science.oregonstate.edu/~landaur/Books/CPbook/eBook/Lectures/)

- [Numerical Methods in Quantum Mechanics (Istituto Nazionale di Fisica Nucleare)](http://www.fisica.uniud.it/~giannozz/Corsi/MQ/mq.html)

### 高速化・並列計算

- [チューニング技法虎の巻](https://www.hpci-office.jp/pages/seminar_texts)

- [OpenMP](https://www.nag-j.co.jp/openMP/openMPHelloOpenMP.html)

- [計算科学技術特論B](https://www.r-ccs.riken.jp/library/event/tokuronB_2020.html)

- [計算科学eラーニング](https://www.youtube.com/channel/UCIgMkEZoA5R_3StG1ZfjHvg/videos)

## プログラミング

### インストール

- [いろいろ](https://zenn.dev/ohno/books/356315a0e6437c)

- [Julia and Jupyter Notebook](https://zenn.dev/ohno/articles/5ad94fb39a3948)

- [Visual Studio Code](https://qiita.com/psychoroid/items/7d85ae6bade4a67aedb1)

- [Visual Studio Code](https://twitter.com/EADGCGDA/status/1157655182110416896)

- [Julia](https://note.com/pekipekky/n/ne65c04e76cf5)

- [Julia](https://github.com/cometscome/Julianotes/blob/master/julianote.md#2-julia%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB)

- [Jupyter Notebook](https://stat-you1025.blogspot.com/2020/08/jupyter-julia.html)

- [Jupyter Notebook](https://nbviewer.jupyter.org/github/genkuroki/msfd28/blob/master/install.ipynb#IJulia%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB)

- [gnuplot](http://www.compe.media.kyoto-u.ac.jp/syoseki/windows/windows-gnuplot.html)

### コーディング

- [Fortran](https://www.nag-j.co.jp/fortran/index.html)

- [Julia](https://github.com/bicycle1885/Julia-Tutorial)

- [Julia](https://github.com/cometscome/Julianotes/blob/master/julianote.md)

- [Julia](https://qiita.com/cometscome_phys/items/31d0b811345a3e12fcef)

### コーディング規約

- [Fortran 標準コーディングルール](https://www.mri-jma.go.jp/Project/mrinpd/coderule.html)

- [PEP8](https://pep8-ja.readthedocs.io/ja/latest/) (Python)

## お金

### インターン

- [PCoMSイノベーション創出人材育成](http://pcoms.imr.tohoku.ac.jp/innovation/)

### 奨学金

- [JASSOの奨学金](https://www.jasso.go.jp/shogakukin/index.html)

- [返さなくていい給付型奨学金をくれる団体](https://xn--kus49bd41h.net/archives/67540341.html)

- [学振](https://www.jsps.go.jp/j-pd/)

### 研究費

- [学振](https://www.jsps.go.jp/j-pd/)

- [ACT-X](https://www.jst.go.jp/kisoken/act-x/index.html)

- [CREST](https://www.jst.go.jp/kisoken/crest/)

- [さきがけ](https://www.jst.go.jp/kisoken/presto/)

- [上記の研究提案募集一覧](https://www.jst.go.jp/kisoken/boshuu/teian.html)

- [科研費](https://www.jsps.go.jp/j-grantsinaid/)

### 論文執筆

- [Summaryの書き方](https://twitter.com/ToyamaYj/status/1042512038952484864?s=20)

## 研究

### 第一原理計算に関連する国内の研究室

- [理化学研究所 計算科学研究センター](https://www.riken.jp/research/labs/r-ccs/)

  - [量子系物質科学研究チーム](https://www.riken.jp/research/labs/r-ccs/comput_mater_sci/index.html)

  - [量子系分子科学研究チーム](https://www.riken.jp/research/labs/r-ccs/comput_mol_sci/index.html)

- [分子科学研究所 江原研究室](http://tc.ims.ac.jp/index.html)

- [北海道大学 量子化学研究室](https://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~qc/)

- [東北大学 計算分子科学研究室](https://comp.chem.tohoku.ac.jp/)

- [JAIST 前沢研究室](https://www.jaist.ac.jp/is/labs/maezono-lab/homepage2019/index.html)

- [東京大学 常行研究室](http://white.phys.s.u-tokyo.ac.jp/index2.php)

- [早稲田大学 中井グループ](http://www.chem.waseda.ac.jp/lab/nakai/)

- [横浜市立大学 量子物理化学研究室](http://www-user.yokohama-cu.ac.jp/~tachi/index.html)

- [横浜国立大学 大野・桑畑研究室](http://www.ohno.ynu.ac.jp/research.html)

- [富山大学 計算物理化学研究室](http://enghp.eng.u-toyama.ac.jp/labs/ac04/)

- [金沢大学 計算物性・物性理論研究室](http://cphys.s.kanazawa-u.ac.jp/)

- [金沢大学 小田研究室](http://cphys.s.kanazawa-u.ac.jp/~oda-web/contents/oda/oda-work.html)

- [岐阜大学 纐纈・宇田川研究室](https://www1.gifu-u.ac.jp/~kulab/udagawa/index.html)

- [京都大学 分子理論化学講座](http://www.riron.moleng.kyoto-u.ac.jp/)

- [京都大学 理論化学研究室](http://bake.kuchem.kyoto-u.ac.jp/riron/index.html)

- [京都大学 田中研究室](http://cms.mtl.kyoto-u.ac.jp/index.html)

- [神戸大学 天能研究室](http://www.gellan.scitec.kobe-u.ac.jp/index.html)

- [九州大学 青木研究室](http://aoki.cube.kyushu-u.ac.jp/research.html)

- [九州大学 山崎仁丈研究室](http://www.inamori-frontier.kyushu-u.ac.jp/materials/)

### ソフトウェア

- [リスト](https://en.m.wikipedia.org/wiki/List_of_quantum_chemistry_and_solid-state_physics_software)

- [MateriApps](https://ma.issp.u-tokyo.ac.jp/app/)

- [Materials Studio](https://www.comtec.daikin.co.jp/SC/ms/)

- [Amber](https://ambermd.org/)

- [VASP](https://www.vasp.at/)

- [Gaussian](https://gaussian.com/)

- [GAMESS](https://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/)

- [CASINO](https://vallico.net/casinoqmc/)

- [TurboRVB](https://people.sissa.it/~sorella/TurboRVB_Manual/build/html/index.html)

- [XDMC](https://github.com/miicck/xdmc)

### オンライン数値計算

- [リスト](http://acetaminophen.hatenablog.com/entry/2015/04/20/153903)

- [WebMO](http://pc-chem-basics.blog.jp/archives/1233772.html)

### 数値計算手法一覧

- [強相関系](https://www.cond-mat.de/events/correl.html)

### 未解決問題

- [化学](https://www.nature.com/collections/gijeadcheb?utm_source=twitter&utm_medium=social&utm_content=ads&utm_campaign=JJPN_1_KI01_JP_comchem_collection_openquestion)

## データベース

### 基底関数データベース

- [Gaussian 日本語マニュアル](https://www.hpc.co.jp/chem/software/gaussian/help/basis_sets/)

- [Basis Set Exchange](https://www.basissetexchange.org/)

### 擬ポテンシャルデータベース

- [Pseudopotential Library](https://pseudopotentiallibrary.org/)

- [Energy-consistent pseudopotentials for QMC calculations](http://burkatzki.com/pseudos/index.2.html)

### 計算値・実験値データベース

- [Computational Chemistry Comparison and Benchmark DataBase (各種物性, 計算値&実験値)](https://cccbdb.nist.gov/)

- [Benchmark Energy & Geometry Database (エネルギー&構造)](http://www.begdb.com/index.php)

- [NOMAD](https://nomad-coe.eu/)

- [OQMD](http://oqmd.org/)

- [The PubChemQC Project (構造最適化)](http://pubchemqc.riken.jp/)

- [Chem Tube 3D (遷移構造)](https://www.chemtube3d.com/)

- [CHESHIRE (NMRスペクトル)](http://cheshirenmr.info/)

### 結晶構造データベース

- [The Materials Project](https://materialsproject.org/)

- [AFLOW](http://www.aflow.org/)

## 可視化

### 可視化サンプル集

- [Demos for gnuplot](http://gnuplot.sourceforge.net/demo_5.4/)

- [PlotsGallery.jl](https://github.com/goropikari/PlotsGallery.jl)

- [Gnuplot.jl](https://lazarusa.github.io/gnuplot-examples/gallery/)

- [The R Graph Gallery](https://www.r-graph-gallery.com/all-graphs)

- [D3](https://observablehq.com/@d3/gallery)

### JavaScript 可視化ライブラリ

- [GLmol](https://webglmol.osdn.jp/index-ja.html)

- [JSmol](https://katakago.sakura.ne.jp/soft/jsmol/index.html)

- [3Dmol.js](https://omedstu.jimdofree.com/2018/03/04/3dmol-js%E3%81%A7%E3%81%AE%E5%88%86%E5%AD%90%E8%BB%8C%E9%81%93%E3%81%AE%E8%A1%A8%E7%A4%BA/)

- [リスト](https://www.octoparse.jp/blog/top-30-data-visualization-tools/)

## デザイン

### 参考

- [スライドについて](http://tomoyukiarasuna.com/make-images/)

- [Reactテンプレート](https://material-ui.com/store/?utm_source=docs&utm_medium=referral&utm_campaign=home-store)

- [Bootstrapテンプレート](https://getbootstrap.jp/docs/5.0/examples/)

- [sankoudesign.com](https://sankoudesign.com/)

- [io3000.com](https://io3000.com/)

- [81-web.com](https://81-web.com/)

- [muuuuu.org](https://muuuuu.org/)

- [siiimple.com](https://siiimple.com/)

- [webdesignclip.com](https://www.webdesignclip.com/)

### 配色

- [配色パターン集](https://webdesign-trends.net/entry/11846#3)

- [Color Hunt](https://colorhunt.co/palettes/popular)

- [HUE/360](https://hue360.herokuapp.com/)

- [RGBと16進数カラーコードの相互変換ツール](https://www.peko-step.com/tool/tfcolor.html)

### 画像

- [pixels.com (写真)](https://www.pexels.com/ja-jp/)

- [beiz.jp (テスクチャ)](https://www.beiz.jp/)

- [publicdomainvectors.org (ベクタ画像)](https://publicdomainvectors.org/)

- [icooon-mono.com (アイコン)](https://icooon-mono.com/)

- [material.io (アイコン)](https://material.io/resources/icons/)

### その他

- [MathJax](https://www.mathjax.org/#gettingstarted)

- [KaTeX](https://nshi.jp/contents/other/katex/)

- [SVG](https://www.bicycle1885.org/blog/2020/blog-svg-test/)
ecosyste.ms

Data

Tools

Indexes

Applications

Experiments

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