https://github.com/percival33/dna-adnotator
https://github.com/percival33/dna-adnotator
Last synced: 8 months ago
JSON representation
- Host: GitHub
- URL: https://github.com/percival33/dna-adnotator
- Owner: Percival33
- Created: 2024-03-29T22:01:58.000Z (about 2 years ago)
- Default Branch: main
- Last Pushed: 2024-03-29T22:12:08.000Z (about 2 years ago)
- Last Synced: 2025-01-23T06:44:58.474Z (over 1 year ago)
- Language: Java
- Size: 4.71 MB
- Stars: 0
- Watchers: 1
- Forks: 0
- Open Issues: 0
-
Metadata Files:
- Readme: README.md
Awesome Lists containing this project
README
# System do adnotacji sekwencji DNA
## Cel projektu
Celem projektu jest stworzenie platformy do wspomagania adnotacji
wariantów splicingowych, która pozwoli na efektywne przetwarzanie i analizę
wariantów genetycznych, zwłaszcza tych, które potencjalnie zaburzają proces
splicingu. System ma być w stanie przetwarzać warianty typu SNV
dla całego genomu, korzystając z kilku wybranych algorytmów, oraz umożliwiać
przeliczenie online wariantów typu INDEL.
## Komponenty systemu
### annotator_ui
Prosty interfejs graficzny, który opcjonalnie może zostać wykorzystany do manualnego wgrywaniu wariantów do adnotacji.
Wygląd UI:
### annotator_core
Główny komponent systemu udostępniający interfejs REST API.
Diagram klas
### annotator_worker
Komponent systemu odpowiadający za efektywne przetwarzania danych genetycznych i wykonywanie algorytmów adnotacji sekwencji DNA.
Diagram klas
