Ecosyste.ms: Awesome
An open API service indexing awesome lists of open source software.
https://github.com/red-data-tools/red_amber
A dataframe library for Rubyists.
https://github.com/red-data-tools/red_amber
apache-arrow dataframe dataframe-library dataframes ruby
Last synced: 5 days ago
JSON representation
A dataframe library for Rubyists.
- Host: GitHub
- URL: https://github.com/red-data-tools/red_amber
- Owner: red-data-tools
- License: mit
- Created: 2022-04-15T12:06:47.000Z (almost 3 years ago)
- Default Branch: main
- Last Pushed: 2024-10-27T05:50:52.000Z (3 months ago)
- Last Synced: 2025-01-14T03:06:37.196Z (12 days ago)
- Topics: apache-arrow, dataframe, dataframe-library, dataframes, ruby
- Language: Ruby
- Homepage:
- Size: 5.52 MB
- Stars: 68
- Watchers: 10
- Forks: 13
- Open Issues: 7
-
Metadata Files:
- Readme: README.ja.md
- Changelog: CHANGELOG.md
- License: LICENSE
Awesome Lists containing this project
README
# RedAmber
[](https://rubygems.org/gems/red_amber)
[](https://github.com/red-data-tools/red_amber/actions/workflows/ci.yml)
[](https://codeclimate.com/github/heronshoes/red_amber/maintainability)
[](https://codeclimate.com/github/heronshoes/red_amber/test_coverage)
[](https://red-data-tools.github.io/red_amber/)
[](https://github.com/red-data-tools/red_amber/discussions)
Rubyistのためのデータフレームライブラリ.
- Powered by [Red Arrow](https://github.com/apache/arrow/tree/master/ruby/red-arrow)
[](https://app.element.io/#/room/#red-data-tools_ja:gitter.im) [](https://rubygems.org/gems/red-arrow)
- Inspired by the dataframe library [Rover-df](https://github.com/ankane/rover)
[README in English](README.md)
## 概要
* RedAmberはRubyで書かれたデータフレームライブラリです。[Apache Arrow](https://arrow.apache.org/)の列指向データフォーマットを扱うことができます。
* Rubyらしいブロックやコレクションを使って、Rubyらしい書き方でデータフレームの操作ができることを目指しています。
* このリポジトリは[開発コンテナ(Dev Container)](https://containers.dev/)をサポートしているので、RedAmberの操作が容易に[試せます](doc/Dev_Containers.ja.md)。
* [使用例が豊富なドキュメント](https://red-data-tools.github.io/red_amber/)と、127項目の主な操作例を記載したJupyter Notebookドキュメントがあります。
## 必要な環境
### Ruby
- Ruby 3.0 以上.
### ライブラリ
```ruby
gem 'red-arrow', '>= 12.0.0' # お使いの環境に合わせた Apache Arrow が必要です
# 下記のインストールを参照してください
gem 'red-arrow-numo-narray' # 必要に応じて。Numo::NArray との連携またはランダムサンプリングが必要な場合。
gem 'red-parquet', '>= 12.0.0' # 必要に応じて。Parquet の入出力が必要な場合。
gem 'red-datasets-arrow' # 必要に応じて。Red Datasets を利用する場合。
gem 'red-arrow-activerecord' # 必要に応じて。Active Record とのデータ交換が必要な場合。
gem 'rover-df' # 必要に応じて。Rover::DataFrame に対する入出力が必要な場合。
```
## インストール
RedAmberをインストールする前に、下記のライブラリのインストールが必要です。
- Apache Arrow (>= 12.0.0)
- Apache Arrow GLib (>= 12.0.0)
- Apache Parquet GLib (>= 12.0.0) # Parquetの入出力が必要な場合。
環境ごとの詳しいインストール方法は、 [Apache Arrow install document](https://arrow.apache.org/install/) を参照してください。
- Ubuntuの場合の最低限必要なインストール例:
```
sudo apt update
sudo apt install -y -V ca-certificates lsb-release wget
wget https://apache.jfrog.io/artifactory/arrow/$(lsb_release --id --short | tr 'A-Z' 'a-z')/apache-arrow-apt-source-latest-$(lsb_release --codename --short).deb
sudo apt install -y -V ./apache-arrow-apt-source-latest-$(lsb_release --codename --short).deb
sudo apt update
sudo apt install -y -V libarrow-dev libarrow-glib-dev
```
- Fedora 39 (Rawhide)の場合:
```
sudo dnf update
sudo dnf -y install gcc-c++ libarrow-devel libarrow-glib-devel ruby-devel libyaml-devel
```
- macOS の場合は、Homebrewを使用する:
```
brew install apache-arrow apache-arrow-glib
```
Apache Arrowがインストールできたら、下記の行をGemfileに追加してください:
```ruby
gem 'red-arrow', '>= 12.0.0'
gem 'red_amber'
gem 'red-arrow-numo-narray' # 必要に応じて。Numo::NArray との連携またはランダムサンプリングが必要な場合。
gem 'red-parquet', '>= 12.0.0' # 必要に応じて。Parquetの入出力が必要な場合。
gem 'red-datasets-arrow' # 必要に応じて。Red Datasets を利用する場合。
gem 'red-arrow-activerecord' # 必要に応じて。Active Record とのデータ交換が必要な場合。
gem 'rover-df', # 必要に応じて。Rover::DataFrameに対する入出力が必要な場合。
```
`bundle install`とするか、または `gem install red_amber`としてインストールしてください。
## Development Containersによる開発環境
このリポジトリは [開発コンテナ(Dev Container)](https://containers.dev/)をサポートしています。
これを使うと、ローカルの環境を変更することなく、RedAmberに必要なツール一式を含んだ環境を準備することができます。この環境には、Ruby、Apache Arrow、RedAmberのソースツリー、GitHub CI、サンプルデータセット、IRubyカーネルを含んだJupyter Labなどが含まれています。
RedAmber用のDev Containerは、`.devcontainer` ディレクトリに必要な設定が書かれています。
使用例は、[開発コンテナ(Development Containers)の利用](doc/Dev_Containers.ja.md)をご参照ください。
## Docker イメージと Jupyter Notebook
（注：将来削除される可能性があります。上記のDev Containerをご活用ください。）
このリポジトリの`docker` フォルダーから Docker コンテナ環境を生成できます。リポジトリをクローンしてから、dockerフォルダーにある [readme](docker/readme.md) を参照してください。その環境では `docker/notebook` フォルダーにある Jupyter Notebookイメージを試用できます。
このREADMEの内容をネットワーク上のJupyter Notebookでインタラクティブに試用することも出来ます。 [Binder](https://mybinder.org/v2/gh/heronshoes/docker-stacks/RedAmber-binder?filepath=red-amber.ipynb).
[](https://mybinder.org/v2/gh/heronshoes/docker-stacks/RedAmber-binder?filepath=red-amber.ipynb)
Jupyter Notebookの環境を含めた他の多くのデータ処理用のライブラリーとともにRedAmberもパッケージングされたDocker Imageとして、[RubyData Docker Stacks](https://github.com/RubyData/docker-stacks) が利用できます(Thanks to Kenta Murata).
## 他のデータフレームライブラリとの比較表
RedAmberの基本的な機能をPython
[pandas](https://pandas.pydata.org/) や
R [Tidyverse](https://www.tidyverse.org/) や
Julia [DataFrames](https://dataframes.juliadata.org/stable/) と比較した表は [DataFrame_Comparison_ja.md](doc/DataFrame_Comparison_ja.md) にあります(Thanks to Benson Muite).
## `RedAmber`のデータフレーム
クラス `RedAmber::DataFrame` は２次元のデータの集まりを表現します。
その実体は Red Arrowの Tableオブジェクトです。
それではライブラリをロードしていくつかの例を試してみましょう。
```ruby
require 'red_amber' # require 'red-amber' でもOKです.
include RedAmber
```
### 例: diamonds データセット
もしまだであれば、Red DatasetsのArrow拡張を`
gem install red-datasets-arrow
`
としてインストールしてから次を実行してください。
```ruby
require 'datasets-arrow' # サンプルデータのロードのため
dataset = Datasets::Diamonds.new
diamonds = DataFrame.new(dataset) # v0.2.3以前では, `dataset.to_arrow`とする必要があります。
# =>
#
carat cut color clarity depth table price x ... z
...
0 0.23 Ideal E SI2 61.5 55.0 326 3.95 ... 2.43
1 0.21 Premium E SI1 59.8 61.0 326 3.89 ... 2.31
2 0.23 Good E VS1 56.9 65.0 327 4.05 ... 2.31
3 0.29 Premium I VS2 62.4 58.0 334 4.2 ... 2.63
4 0.31 Good J SI2 63.3 58.0 335 4.34 ... 2.75
: : : : : : : : : ... :
53937 0.7 Very Good D SI1 62.8 60.0 2757 5.66 ... 3.56
53938 0.86 Premium H SI2 61.0 58.0 2757 6.15 ... 3.74
53939 0.75 Ideal D SI2 62.2 55.0 2757 5.83 ... 3.64
```
例えば、1カラット以下のレコードに対し、cut毎の平均のpriceを求めるには次のようにします。
```ruby
df = diamonds
.slice { carat > 1 } # #sliceの代わりに#filterでも可
.group(:cut)
.mean(:price) # ここで:priceを指定する場合はgroupの前のpickは不要
.sort('-mean(price)')
# =>
#
cut mean(price)
0 Ideal 8674.23
1 Premium 8487.25
2 Very Good 8340.55
3 Good 7753.6
4 Fair 7177.86
```
Arrowのデータはイミュータブルなので、これらのメソッドは新しいオブジェクトを返します。
次の例は、列をリネームしてから新しい列に簡単な計算の結果を格納します。
```ruby
usdjpy = 110.0 # 今よりずっと円高の頃
df.rename('mean(price)': :mean_price_USD)
.assign(:mean_price_JPY) { mean_price_USD * usdjpy }
# =>
#
cut mean_price_USD mean_price_JPY
0 Ideal 8674.23 954164.93
1 Premium 8487.25 933597.34
2 Very Good 8340.55 917460.37
3 Good 7753.6 852896.11
4 Fair 7177.86 789564.12
```
### 例: starwars データセット
次の例は、CSVファイルをダウンロードして`starwars` データセットを読み込みます。その後簡単なデータのクリーニングを行います。
```ruby
uri = URI('https://vincentarelbundock.github.io/Rdatasets/csv/dplyr/starwars.csv')
starwars = DataFrame.load(uri)
starwars
.drop(0) # 不要な列を取り除く
.remove { species == "NA" } # 不要な行を取り除く
.group(:species) { [count(:species), mean(:height, :mass)] }
.slice { count > 1 } # #filterでも可
# =>
#
species count mean(height) mean(mass)
0 Human 35 176.65 82.78
1 Droid 6 131.2 69.75
2 Wookiee 2 231.0 124.0
3 Gungan 3 208.67 74.0
4 Zabrak 2 173.0 80.0
5 Twi'lek 2 179.0 55.0
6 Mirialan 2 168.0 53.1
7 Kaminoan 2 221.0 88.0
```
より詳しいデータフレームの使用例については、[DataFrame.md](doc/DataFrame.md) をご参照ください。
### 1次元のデータを保持する `Vector`
クラス`RedAmber::Vector` はデータフレームの中の列方向に格納された１次元のデータ列を保持します.
より詳しい使用例については [Vector.md](doc/Vector.md) をご参照ください。
## Jupyter Notebook
このリポジトリでは [Quarto](https://quarto.org/) を使って、操作例を載せたJupyter Notebookのソースはqmd形式で保存し、gitの管理下に置いています。Notebookの生成は開発コンテナを使うと便利です。詳しくは[開発コンテナ(Development Containers)の利用](doc/Dev_Containers.ja.md)を利用して下さい。
## 開発
Dev Containersを利用してコンテナ上に開発環境を作成する方法がお勧めです。[開発コンテナ(Development Containers)の利用例](doc/Dev_Containers.ja.md)を参考にしてください。
または、ローカル環境に必要なライブラリをインストールした上で、下記を実行するとテストが走ります。
```shell
git clone https://github.com/red-data-tools/red_amber.git
cd red_amber
bundle install
bundle exec rake test
```
RedAmberの開発では、`rake test` は必須ですが、`rake rubocop` をパスすることはコントリビュートの際に必須ではありません。このプロジェクトではコードの書き方の好みを尊重します。ただしマージの際に書き方を統一させていただくことがあります。
## コミュニティ
このプロジェクトを支援して頂けると嬉しいです。支援の方法はいくつかあります。
- [discussions](https://github.com/heronshoes/red_amber/discussions)でお話ししましょう! [](https://github.com/red-data-tools/red_amber/discussions)
- Q and Aや使用方法、豆知識などを見ることができます。
- 疑問に思っていることを質問できます。
- 新しいアイデアを共有する。アイデアはdiscussionからissueに昇格させて育てていくこともあります。漠然としたアイデアでもdiscussionから始めて大きくしていきましょう。
- [バグ報告や新しい機能の提案](https://github.com/red-data-tools/red_amber/issues)
- バグの修正や[プルリクエスト](https://github.com/red-data-tools/red_amber/pulls)
- ドキュメントを修正したり、不明確なところを直したり、新しく追加しましょう。
皆さんのご参加をお待ちしています。
## License
The gem is available as open source under the terms of the [MIT License](https://opensource.org/licenses/MIT).