https://github.com/sergiocorreia/data-covid-minsa

limpieza rapida de datos de covid de minsa
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covid-19-peru

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limpieza rapida de datos de covid de minsa

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• URL: https://github.com/sergiocorreia/data-covid-minsa
• Owner: sergiocorreia
• License: mit
• Created: 2020-05-22T04:27:22.000Z (over 4 years ago)
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• Topics: covid-19-peru
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# Limpieza rapida de datos de covid de minsa

*(ultima descarga de MINSA: Sábado 30 de mayo de 2020 11pm)*

## Ejemplos de analisis

Los datos más recientes (en lineas punteadas) se suelen revisar a la alza, asi que no los tomen como un indicio de cambios de la situación.











### Exceso de mortalidad en Lima Metropolitana, por rango de edad











## Fuentes

- Thread: https://twitter.com/Jlincio/status/1263642080968089601

- Casos positivos: https://www.datosabiertos.gob.pe/dataset/casos-positivos-por-covid-19-ministerio-de-salud-minsa

- Fallecidos por COVID-19: https://www.datosabiertos.gob.pe/dataset/fallecidos-por-covid-19-ministerio-de-salud-minsa

- Fallecidos (Sistema Nacional de Defunciones SINADEF): https://www.datosabiertos.gob.pe/dataset/informaci%C3%B3n-de-fallecidos-del-sistema-inform%C3%A1tico-nacional-de-defunciones-sinadef-ministerio

- Ubigeos 2019 de: https://github.com/ernestorivero/Ubigeo-Peru

- Poblacion por distrito: https://www.inei.gob.pe/estadisticas/indice-tematico/poblacion-y-vivienda/ . Esta solo al 2015 y en Excel, asi que use esta que es mas accesible: https://github.com/geodir/ubigeo-peru/blob/master/geodir-ubigeo-inei.csv (pero la del INEI tiene por rangos de edad, que permitiria calcular poblacion vulnerable)

- Concordancia de ubigeos: https://github.com/CONCYTEC/ubigeo-peru/blob/master/equivalencia-ubigeos-oti-concytec.csv

## Pasos

*(El codigo esta en Stata, que lamentablemente no es de codigo abierto)*

1. Actualizar datos de MINSA

2. Ejecutar programa `create_all.do`

## Algunas observaciones

- Las fechas se reportan a veces en formatos incompatibles (por ejemplo 2019-12-31 vs 31/12/2019)

- Hay fechas invalidas (de nacimiento, de examen, etc.)

- Hay combinaciones de departamento, provincia, distrito que no tienen correspondencia con ubigeos. En la mayoria de casos el error es obvio y fue corregido

- Los duplicados fueron removidos

- Cuando una persona tiene multiples pruebas positivas, solo guarde la primera