https://github.com/tesar-tech/bif-cell-division-homework
Domácí úloha pro studenty Bioinformatiky
https://github.com/tesar-tech/bif-cell-division-homework
Last synced: 2 months ago
JSON representation
Domácí úloha pro studenty Bioinformatiky
- Host: GitHub
- URL: https://github.com/tesar-tech/bif-cell-division-homework
- Owner: tesar-tech
- Created: 2017-11-27T16:10:56.000Z (over 8 years ago)
- Default Branch: master
- Last Pushed: 2017-12-12T09:12:53.000Z (over 8 years ago)
- Last Synced: 2026-01-01T02:37:45.975Z (6 months ago)
- Language: Matlab
- Homepage: https://predmety.fbmi.cvut.cz/cs/17pbibif
- Size: 415 KB
- Stars: 0
- Watchers: 0
- Forks: 0
- Open Issues: 0
-
Metadata Files:
- Readme: README.md
Awesome Lists containing this project
README
Mitóza a meióza
===============
Tato úloha slouží k pochopení základních procesů probíhajících při
buněčném dělení především z hlediska genetiky. Úkolem je v MATLABu
doprogramovat sadu podpůrných funkcí a funkce pro meiózu a mitózu.
Popis úlohy
-----------
Pro demonstraci fungování buněčného dělení složí ukázkový jednobuněčný
organismus. Tento organismus je pro snadnější pochopení a implementaci
značně zjednodušen. Obsahuje pouze jeden pár chromozomů (v diploidním
stavu má tedy 2 chromozomy). Na každém chromozomu figurují tři geny.
Každý gen je zodpovědný za jednu vlastnost (barva, tvar, barva okraje).
Organismus se může rozmnožit nepohlavně (mitoticky) i pohlavně
(využívaje meiózu) a to i přes to, že nemá žádný znak zodpovědný za
pohlaví (u člověka je tímto znakem na genetické úrovni chromozom X a Y).
Součástí zadání je implementovaný kód pro tvorbu náhodného organismu
(*getRandomOrganism*) a funkce pro vykreslení organismu
(*drawOrganism*). Použití těchto funkcí je v souboru *SCRIPT.m*, který
slouží jako spouštěč a rozcestník pro ostatní funkce.
*Obr. 1: Dva vykreslené organismy. V genech zakódované vlastnosti pro
tento organismus jsou tvar, barva a barva okraje.*
Zadání
------
Doprogramujte funkce: *mitosis, meiosis, divisionOfTetraploid,
replicateDNA, sexualReproduction*. Funkce na sebe jistým způsobem
navazují. K dispozici jsou hlavičky funkcí a komentáře vystihující
přibližnou implementaci. Popis struktur a návazností funkcí je
v následujících částech dokumentu. Důležité je pochopit, jak procesy
buněčné reprodukce fungují.
Popis organismu
---------------
Organismus se v diploidním stavu skládá ze dvou chromozomů, každý
chromozom obsahuje tři geny. Následující obrázek odpovídá struktuře
v MATLABU ve které je organismus uložen.
*Obr. 2: Popis organismu*
Popis funkcí
-------------
Funkce přibližně odpovídají jednotlivým dějům při buněčném dělení:
*Obr. 3: Navržené funkce pro buněčné dělení*
Pohlavní rozmnožení organismu
-----------------------------
Funkce *sexualReproduction* bude implementovat pohlavní rozmnožování
organismů. Bude zde volána funkce *meiosis* pro tvorbu haploidních
buněk. Volání funkce a vizualizace výsledků je již naprogramovaná
v souboru SCRIPT.m.
*Obr. 4: Vizualizace pohlavního rozmnožování organismů*